Gut das Du Daten mit lieferst, aber es ist ein ziemliches Chaos, weil man nur erraten kann was Du haben willst. Anscheinend willst Du Win98SE auch auf der zweiten Festplatte haben und zwar als Experimentierpartition.
Es mag exotische Bootmanager geben mit denen alles mögliche geht, aber im Allgemeinen startet Win98SE nicht von der zweiten Festplatte und man sollte es dabei belassen. Außerdem gilt ebenso: Win98SE braucht auf jeden Fall eine Primärpartition. Und dann ist meine Erfahrung, dass man zwei Win98 Partitionen am Besten so einrichtet: Am Anfang der Festplatte, jeweils 2000 MB groß. Cluster auf 8k einstellen. Theoretisch sollte viel mehr gehen (mit einem nicht zu alten Bios), blos hat das bei mir noch nie zuverlässig funktioniert. Die Daten und ev. manche Programme kommen dann auf Logische Partitionen weiter hinten.
Die Platten sind ja sehr unterschiedlich groß und wenn Du experimentieren willst, musst Du wohl die große als Platte 1 nehmen (Master am Ende des IDE-Kabels). Auf der zweiten Festplatte, kannst Du dann Betriebssytem und die wichtigsten Programme und Daten sichern. Mit wieviel MB wird Deine große Festplatte im Bios erkannt?? - Wichtige Frage.
Das Kopieren mit PartitionMagic funktioniert bei meiner Version 5 überhaupt nicht, der Button bleibt blass! Ich mache das eh immer mit Drive Image (von Datenträger zu Datenträger also partitionsweise). Damit ist es möglich die erste Festplatte exakt auf die zweite zu kopieren, aber nur wenn die zweite groß genug und leer ist (aber partitioniert, am besten als Abbild der ersten, bzw. wie die erste werden soll). Das geht nur teilweise bei unterschiedlich großen Platten.
Damit es keinen Ärger gibt, stellt man die fertig kopierten Partitionen auf "versteckt" ein, sonst sind die Laufwerksbuchstaben durcheinander und ev. auch die Anwendungspfade. Wenn Du irgendwann mal nur einzelne Dateien von der zweiten Festplatte zurückzuspielen hast, muss die Partition allerdings dazu zwischenzeitlich angezeigt werden.
Wenn Du Dir die erste Festplatte passend nach Bedarf (Experimentierpartition) einrichtest, kannst Du Deine Installation und Deine Daten zurückkopieren.
Bei einigen dieser Aktionen hast Du kein Betriebssytem auf der ersten Festplatte. Du startest dann PartitionMagic mit Windows-Startdiskette und PartitionMagic Programmdiskette und dem Befehl pqmagic.
Wenn Du anfängst Partitionsgrößen von belegten Partitionen (Daten drauf) zu verändern solltest Du schon ein Backup haben. Und vorher Defragmentieren. Die Aktion nie unterbrechen, die dauert. Wenn alles läuft, danach immer die Notfalldiskette erneuern.