Am sichersten ist es, wenn man das 2. W2K in einem anderen Verzeichnis, wenn möglich sogar auf einer anderen Platte ablegt.
Dann mit diesem booten und das Verzeichnis des 1. W2K (und seinen Eintrag im Bootmenü in C:boot.ini) löschen.
Liegt das 2. W2K auf einer anderen Partition als die Nr. 1, dann kann das Verzeichnis Programme auf der Nr-1-Partition
auch gelöscht werden.
Du kannst natürlich auch die ganze Partition von Nr. 1 neu formatieren lassen, dann ist aber ALLES weg, auch die anderen
Progs & Daten auf der Nr. 1-Partition, die Du zwischenzeitlich installiert bzw. angelegt hast!
Die "Kommandozeilenversion" von W2K ist über die entsprechenden Eintrag im Bootmenü zu erreichen.