Wenn die Platte schon formatiert wurde, ist Datensicherung wohl kein Thema...oder doch?
Die Festplatte kann man mit einem Tool vom Festplattenhersteller testen, das Tool wäre von der entsprechenden Internetseite herunterzuladen. Die Sache ist langwierig und nicht 100% zuverlässig. Man kann auch den MBR gründlich löschen (killmbr) und mal die Platte auf Linux ext2 umformatieren (so tun als wolle man Linux installieren, aber nach dem Formatieren abbrechen). Wieder killmbr und Festplatte im Bios erkennen lassen. Und dann würde ich mal die ersten 2 GB auf FAT-16 formatieren (etwa mit Windows Startdiskette starten und mit Programmdiskette von PartitionMagic arbeiten).
Danach die Platte wie gewohnt mit FDISK einrichten: Partitionen anlegen, Betriebssystempartition aktivieren, Neustart, Formatieren und Installation von Windows, Treibern und Programmen.
Infos finden sich auch noch jede Menge im Posting-Archiv, Bereich Festplatten.
http://www.heise.de/ct/ftp/result.xhtml?url=/ct/ftp/ctsi.shtml&words=killmbr
Natürlich ist ein Festplattendefekt nicht auszuschließen, aber auch Dateisystemfehler können Geräusche verursachen. Das Geräusch sollte mal genau beschrieben werden, vielleicht kennt es jemand.