Entweder man macht ein Image, dann kann man das gesamte System relativ einfach wieder herstellen.
Oder man sichert einzelne Dateien, weil das Speicher sparrt und schneller geht.
Programme und das Betriebsystem kann man relativ einfach wieder installieren und müssen nicht gesichert werden.
Ich bin Linuxanwender und nutze deshalb rsync für die Sicherung wichtiger Dateien. Weil Linux eine sehr funktionelle Verzeichnisstruktur (/etc, /home, /var /usr ...) wie Unix nutzt, kann man sehr leicht nur bestimmte, wichtige Dateien sichern und muß nicht das gesamte System kopieren.
rsync gibt es auch für Windows und man kann Batchdateien für die Sicherung der Dateien schreiben.
Unter Unix/Linux erstellt man Shellscripte .
http://wiki.njh.eu/mediawiki/index.php?title=Rsync_unter_Windows&printable=yes
http://www.heinlein-support.de/web/support/wissen/rsync-backup/