Ich bin verwirrt weil alle 3 Platten unter ubuntu angezeigt werden:
Ich nicht, weil Linux sich nicht um die Windows-Konventionen kümmert. Egal ob das Ding an USB oder wo auch immer angeprömpelt ist, wird eine gesunde Platte eingebunden.
Wie kann ich rausfinden welche Platte die nicht funktionierende, geklonte Platte ist? Das müsste über die Größe gehen weil die geklonte Platte 480GB hat und die Systemplatte 250GB. Mit welchem Befehl geht das?
Auf der Konsole geht das am ehesten mittels sudo fdisk -l. Dann siehst Du zumindest die Grösse der Platte und den zugewiesenen Laufwerksbuchstaben im Sinne von /dev/sdx.
Einfacher und per Klickibunti startest Du GParted und bekommst die Platten dann physikalisch und in der richtigen Grösse angezeigt. Sollte es noch nicht vorhanden sein, installierst Du es eben nach:
https://wiki.ubuntuusers.de/GParted/
Dann kannst Du auch gleich den dynamischen Datenträger der SSD plätten und neu formatieren. Klappt es mit GParted nicht, dann bleibt immer noch testdisk. Linux vergreift sich per se z.B. nicht an Platten, die laut Journal nicht sauber ausgehängt wurden (z.B. wegen einer Hibernate-Partition).