Wenn ich das richtig verstehe, kommen sich der Onboard IDE-Raid-Controller und der SCSI Controller ins Gehege.
Da könnte ACPI dran schuld sein.
Du musst ACPI deaktivieren - schau dazu mal im Archiv unter "Windows 2000 ACPI" nach.
Das musst Du irgenwie in der Systemsteuerung abschalten, und dann im Mainboard Bios abschalten.
Mach aber vorher eine Sicherung Deiner wichtigen Dateien - es kann sein, dass Win2000 nach der Deaktivierung von ACPI nicht mehr startet.
In diesem Fall kannst Du es dann noch mit einer Reparatur von Win2000 versuchen.
Dazu findest Du bestimt was im Archiv "Windows 2000 reparatur"
Es kann danach zu Shutdown-Problemen kommen - dazu findest Du aber auch was im Archiv "Windows 2000 Shutdown"