Ich könnte jetzt hier einen unendlich langen Aufsatz reinkopieren, der alle denkbaren Möglichkeiten abhandelt... . Aber die wichtigsten Dinge wurden genannt. Vielleicht noch Systemsteuerung, Netzwerk, DFÜ-Adapter, IP-Paketgröße Automatisch. Zumindest Win98 verträgt keine andere Einstellung.
Ich beschränke mich mal auf meine letzten - eher untypischen - Erfahrungen:
Die MTU und MSS-Werte werden meist zu hoch angesetzt.
Das Java Runtime Environment, das man sich vom Sun Server herunterlädt, sollte man nur auf Standart einstellen (Systemsteuerung, Java Plug-in, Erweitert).