Der "BigDriveEnablers" ist ein Diskmanager, mag sein, daß das Problem damit gelöst ist, hat aber eine Menge Einschränkungen: z. B. kannst/darfst du keinen Bootmanager verwenden und auch dann niemals mehr direkt von Floppy/CD booten! Außerdem sind Tools wie PM & Co. dann ebenfalls tabu!
S-ATA sollte eigentlich automatisch 48 Bit können, W98 kann standardmäßig nur 128 GB (außer DOS-Box + abges. Modus). Falls S-ATA als -RAID-Controller läuft, ginge W98 dann auch mit über 128 GB, da anderer Treiber (im Gerätemanager überprüfen!).
Ob der Diskmanager das Problem von W98 überhaupt behebt, bezweifle ich etwas. Falls nicht, bekommst du irgendwann gigantischen Datenverlust, wenn die Platte über 127 GB beschrieben wird.