MS-DOS 6.22 kann nur FAT 16 (max. 2 GB), mit vier Partitionen sollten da aber auch 8 GB möglich sein.
Es haben hier schon Leute geschafft, MS-DOS 6.22 auf eine große Platte (Mulitboot) mit draufzumachen und dann einen Haufen Ärger gehabt (geänderter MBR, ...). Deswegen die Warnung. Für Win 3.11 dürfte ähnliches gelten.
W98 (auch 1.) geht aber problemlos bis 127 GB (mal abgesehen von ggf. Scandisk und Defrag), selbst darüber mit Patch (kostenpflichtig), IAA oder RAID-Controller (48 Bit BIOS). Bei mir läuft die 200 GB Wechselplatte auch problemlos mit W98 (1.) am DC100.
W98 (bzw. dessen DOS 7.x) unterstützt BIOS-Extensions und nutzt im DOS-Modus das BIOS zur Adressierung. Deshalb klappen sogar mit dem DOS/abgesicherten Modus der 1. Edition Platten über 127 GB.